Студентски парламент Универзитета у Нишу има своју структуру коју пре свега чине:
Председник: Има задатак да заказује и води седнице Студентског парламента, предлаже дневни ред, предлаже потпредседнике Студентског парламента, именује секретара Студентског парламента, заказује и води седнице председничког савета, представља Студентски парамент у јавности и пред другим институцијама. Бира се на период од годину дана.
Студент проректор: Представља спону између Ректората и Студентског парламента Универзитета, представља Студентски парламент у јавности и пред другим институцијама, упознаје јавност са радом и одлукама Студентског парламента Универзитета. Бира се на период од годину дана.
Студент омбудсман: Штити права студената и даје правно мишљење о томе да ли су нека од права студената угрожена, заступа интересе студената у јавности.
Заменик председника: У одсуству председника Студентског парламента обавља све дужности председника. Може имати један од ресора.
Секретар: Има задатак да се стара о архиви Студентског парламента Универзитета у Нишу, као и функцију саветника председника Студентског парламента, студента проректора, заменика председника и свих потпредседника.
Потпредседници: Број потпредседника варира, најчешће их је пет и сваки од њих је задужен за засебан ресор како би допринели лакшем спровођењу акција Студентског парламента Универзитета.
